RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	RNF122	Q9H9V4	155 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PI4KA	P42356	2102 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ACTL6A	O96019	429 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ADH4	P08319	380 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM6	P0DI80	62 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	LTBR	P36941	435 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OPRK1	P41145	380 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RHOB	P62745	196 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MOB3B	Q86TA1	216 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SAP25	Q8TEE9	199 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MOB3A	Q96BX8	217 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	HES7	Q9BYE0	225 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RNF222	A6NCQ9	220 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OOEP	A6NGQ2	149 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		H0YL77	283 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFB3	O43676	98 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FGF5	P12034	268 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CHRNB4	P30926	498 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PCOLCE	Q15113	449 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	POC1A	Q8NBT0	407 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NPTN	Q9Y639	398 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GTI1	187 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPE3	182 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	IGHM	P01871	453 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SP1	P08047	785 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TCL1A	P56279	114 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	KHDC3L	Q587J8	217 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PITX3	O75364	302 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GYPA	P02724	150 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MST1	P26927	711 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	G0S2	P27469	103 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GNG4	P50150	75 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TPPP2	P59282	170 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FUT9	Q9Y231	359 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CA11	O75493	328 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MELTF	P08582	738 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GZMH	P20718	246 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TGIF1	Q15583	401 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR4S2	Q8NH73	311 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RARRES2	Q99969	163 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CAD	P27708	2225 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		A8MXK9	166 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	C21orf140	B9A014	251 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RAB7A	P51149	207 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TIMD4	Q96H15	378 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM56	Q96MV1	263 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GINS3	Q9BRX5	216 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	DBX1	A6NMT0	343 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TMPRSS2	O15393	492 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	BCL2	P10415	239 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	COX6A1	P12074	109 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CSN1S1	P47710	185 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PAX5	Q02548	391 aa		6.94	□□□□□ -1.3

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