RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.3□□□□□ -1.4
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GARNL3-218ENST00000487565 FAM157AC9JC47 383 aa6.3□□□□□ -1.4
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GARNL3-218ENST00000487565 FABP7O15540 132 aa6.3□□□□□ -1.4
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GARNL3-218ENST00000487565 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.3□□□□□ -1.4
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GARNL3-218ENST00000487565 B4DSR2 109 aa6.29□□□□□ -1.4
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GARNL3-218ENST00000487565 C16orf87Q6PH81 154 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 Q6ZPA2 131 aa6.29□□□□□ -1.4
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GARNL3-218ENST00000487565 OR1L1Q8NH94 360 aa6.29□□□□□ -1.4
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GARNL3-218ENST00000487565 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.29□□□□□ -1.4
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GARNL3-218ENST00000487565 GNG12Q9UBI6 72 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 OPN4Q9UHM6 478 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.28□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.28□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.28□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 C15orf65H3BRN8 121 aa6.28□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 M0QYG6 137 aa6.28□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 BET1O15155 118 aa6.28□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 HSPA12AO43301 675 aa6.28□□□□□ -1.4
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