RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 RNF150Q9ULK6 438 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C5orf51A6NDU8 294 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 GPR31O00270 319 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C1QL1O75973 258 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LY6HO94772 140 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV2-14P01704 120 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 OR8U9P0C7N5 309 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 IFITM2Q01629 132 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PAX5Q02548 391 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C9orf62Q8N4C0 152 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 OR8U1Q8NH10 309 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 COQ8AQ8NI60 647 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 GLYATL2Q8WU03 294 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 OR10C1Q96KK4 312 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TP53RKQ96S44 253 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PDCD10Q9BUL8 212 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 HSPB11Q9Y547 144 aa12.76□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0B4J2A0 478 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 OMGP23515 440 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 P2RX3P56373 397 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 UTF1Q5T230 341 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C6orf183Q5T699 404 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LPCAT3Q6P1A2 487 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 FAM219AQ8IW50 185 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf87Q8N0U7 546 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 OR5D13Q8NGL4 314 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 FAM210AQ96ND0 272 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 DNTTIP1Q9H147 329 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SHPKQ9UHJ6 478 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 DOCK11Q5JSL3 2073 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.75□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SIGLEC5O15389 551 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LUMP51884 338 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LHFPL5Q8TAF8 219 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 GALNT14Q96FL9 552 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 OR2S2Q9NQN1 319 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 USF3Q68DE3 2245 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV3-7P01780 117 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 DANCRP0C864 163 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 IGFBP2P18065 325 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 GZMHP20718 246 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C17orf58Q2M2W7 97 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CR1LQ2VPA4 569 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf71Q6IPW1 123 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LYZL2Q7Z4W2 148 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM246Q9BRR3 403 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 RAB18Q9NP72 206 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CBLN4Q9NTU7 201 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LAMP3Q9UQV4 416 aa12.74□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 AKAP6Q13023 2319 aa12.73□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CGB3P0DN86 165 aa12.73□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CGB7P0DN87 165 aa12.73□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFB7P17568 137 aa12.73□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SSTR2P30874 369 aa12.73□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 HFEQ30201 348 aa12.73□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 GSG1LQ6UXU4 331 aa12.73□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TCF23Q7RTU1 214 aa12.73□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa12.73□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SPINT2O43291 252 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ADAM20O43506 726 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PPOXP50336 477 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ERVFRD-1P60508 538 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 RND3P61587 244 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 GGNBP1Q5YKI7 109 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LIAT1Q6ZQX7 453 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 BVESQ8NE79 360 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C14orf79Q96F83 325 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 FAM234AQ9H0X4 552 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CXCL2P19875 107 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CMTM1Q8IZ96 169 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 FAM185AQ8N0U4 392 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 C5orf30Q96GV9 206 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SUCNR1Q9BXA5 334 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TOLLIPQ9H0E2 274 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 GSKIPQ9P0R6 139 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CTSZQ9UBR2 303 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 KCNS2Q9ULS6 477 aa12.72□□□□□ -0.37
CASQ1-201ENST00000368078 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms