RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 OR1C1Q15619 314 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 A0A087WWC5 75 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ST8SIA5O15466 376 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 FOSL1P15407 271 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 PAX9P55771 341 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 PKIAP61925 76 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 Q3ZCU0 254 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 R4GN57 208 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC31A2O15432 143 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 METTL15P1P0C7V9 234 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CASP6P55212 293 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 RPS16P62249 146 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TLE4Q04727 773 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 P2RY6Q15077 328 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ADIRFQ15847 76 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 DCAF10Q5QP82 559 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF611Q8N823 705 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CRIM1Q9NZV1 1036 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 PDCD6O75340 191 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF726P1Q15940 193 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SSX2Q16385 188 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 STX12Q86Y82 276 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF664Q8N3J9 261 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 PRR18Q8N4B5 295 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 OR4X1Q8NH49 305 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 WASF3Q9UPY6 502 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 KNTC1P50748 2209 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SP9P0CG40 484 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 HERPUD1Q15011 391 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF787Q6DD87 383 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 EXTL1Q92935 676 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SPSB4Q96A44 273 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 PRDM14Q9GZV8 571 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CLDN34H7C241 214 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CDS2O95674 445 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CD59P13987 128 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 COL10A1Q03692 680 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TESK1Q15569 626 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ELOVL1Q9BW60 279 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 GPR87Q9BY21 358 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 C5orf49A4QMS7 147 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 GZMBP10144 247 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 BMP5P22003 454 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 G0S2P27469 103 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SSTP61278 116 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ARL16Q0P5N6 197 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF124Q15973 351 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 C3AR1Q16581 482 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 Q6ZRM9 215 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 IL36GQ9NZH8 169 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 IL17BQ9UHF5 180 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC22A20A6NK97 555 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF732B4DXR9 585 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SOX15O60248 233 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 DEFA4P12838 97 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 BCL3P20749 454 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 RBM11P57052 281 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 OR8G1Q15617 311 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 COLCA1Q6ZS62 124 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM251Q8N6I4 163 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM37Q8WXS4 190 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 DOCK11Q5JSL3 2073 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SYNGR4O95473 234 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 AMBPP02760 352 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TAS2R30P59541 319 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 PLGLB1Q02325 96 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF488Q96MN9 340 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ATP5SQ99766 215 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 LINC00470Q9BZP3 86 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 PLK3Q9H4B4 646 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 A0A1B0GU03 582 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TK1P04183 234 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 NRN1LQ496H8 165 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 RBKSQ9H477 322 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SIRT7Q9NRC8 400 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ABI3Q9P2A4 366 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TSPAN17-201ENST00000298564 HS3ST1O14792 307 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms