RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 GAFA1Q96PS6 74 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 GYPAP02724 150 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 IGFBP2P18065 325 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 SSTR5P35346 364 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL17Q92583 94 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 MGST3O14880 152 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 FCN3O75636 299 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 DIRAS3O95661 229 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV2-14P01704 120 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 IRF2P14316 349 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 RAP2BP61225 183 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf88Q6PI97 169 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF561Q8N587 486 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 HYLS1Q96M11 299 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 GPHA2Q96T91 129 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL13Q99616 98 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-201ENST00000284957 C15orf65H3BRN8 121 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 C1QL1O75973 258 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 CD8AP01732 235 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 HBZP02008 142 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB14P61106 215 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 AANATQ16613 207 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 FGFRL1Q8N441 504 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0B4J2A0 478 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 ODAMA1E959 279 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC30A6NM36 301 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 MPTX1A8MV57 137 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAP1O75689 374 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNA2P01563 188 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF224P0DH78 156 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 DNASE1P24855 282 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 CTAG1AP78358 180 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 CR1LQ2VPA4 569 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 SP6Q3SY56 376 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF843Q8N446 348 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT14Q96FL9 552 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 LURAP1Q96LR2 239 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00052Q96N35 136 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 NAA60Q9H7X0 242 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5AC1P0C628 307 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 GALMQ96C23 342 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC22AQ96IW7 307 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 ARID1AO14497 2285 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 SOD3P08294 240 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 CEACAM6P40199 344 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 GNMTQ14749 295 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 MPPED1O15442 326 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM187Q14656 261 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 TCF23Q7RTU1 214 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 RFESDQ8TAC1 157 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 TP53RKQ96S44 253 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIAL4DF5H284 164 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 HSD17B6O14756 317 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 HSPA12AO43301 675 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 DANCRP0C864 163 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 CGB3P0DN86 165 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 CGB7P0DN87 165 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 EDDM3BP56851 147 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 B2MP61769 119 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 COQ8AQ8NI60 647 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL11Q969Q4 196 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms