RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 HPRT1P00492 218 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A15PP0C7V4 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A13PP0C7W8 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A14PP0C7W9 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A24PP0C7X0 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 CSRP3P50461 194 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM252Q8N6L7 170 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF788Q6ZQV5 615 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 OR1K1Q8NGR3 316 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A38Q96DW6 304 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 NPTNQ9Y639 398 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 SFTPA2Q8IWL1 248 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC5AQ9NY25 188 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 COA4Q9NYJ1 87 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 SNURFLB1AK76 121 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 MESP2Q0VG99 397 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 LYPD8Q6UX82 237 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ORM1P02763 201 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 OR8I2Q8N0Y5 310 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 AMELYQ99218 206 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 TTTY12Q9BZ98 90 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 OR5AC2Q9NZP5 309 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 TUBD1Q9UJT1 453 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 CD1BP29016 333 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM222Q9H0R3 208 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 UFC1Q9Y3C8 167 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS53Q2L4Q9 553 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS11Q6UWP2 260 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ASCL3Q9NQ33 180 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 WIPI2Q9Y4P8 454 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 IER3P46695 156 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 TXNDC17Q9BRA2 123 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 NPVFQ9HCQ7 196 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 CLN8Q9UBY8 286 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 IL19Q9UHD0 177 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 MPDU1O75352 247 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 PPOXP50336 477 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 STARD4Q96DR4 205 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 SCN3AQ9NY46 2000 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 APC2O95996 2303 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 MGST3O14880 152 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 RAB29O14966 203 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 IL11P20809 199 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 PRDX2P32119 198 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 F2RL2O00254 374 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 OR2V2Q96R30 315 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 PKIAP61925 76 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 OR5R1Q8NH85 324 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 MELTFP08582 738 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 AQP3Q92482 292 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC6Q9BQY6 131 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 CORTO00230 105 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf97H3BN30 126 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF488Q96MN9 340 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM208Q9BTX3 173 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 OR51B2Q9Y5P1 312 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF98A6NK75 572 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 M0R296 226 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 TREM2Q9NZC2 230 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 HSPB8Q9UJY1 196 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PP11 408 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRD5 423 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRF3 423 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRM7 423 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 APCSP02743 223 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 COL10A1Q03692 680 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF383Q8NA42 475 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 RUNX1Q01196 453 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC75AQ8NAA5 344 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD2BA6NFX1 497 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 TFF2Q03403 129 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF11Q5DX21 431 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 WDFY1Q8IWB7 410 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 P2RY4P51582 365 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 RPL31P62899 125 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF343Q6P1L6 599 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 LDLRAD3Q86YD5 345 aa18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms