RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.5□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 HEXAP06865 529 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 ARR3P36575 388 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 ODF1Q14990 250 aa8.49□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 C10orf35Q96D05 121 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 TAAR6Q96RI8 345 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.49□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 A0A1B0GV50 99 aa8.49□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 A8MWP6 167 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 DHODHQ02127 395 aa8.49□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.49□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 AGAP20933 346 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 CDKN1BP46527 198 aa8.48□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 RNF122Q9H9V4 155 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.48□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 GLP1RP43220 463 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 SPSB4Q96A44 273 aa8.48□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.47□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 DUSP13Q9UII6 198 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.47□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 BCL2L11O43521 198 aa8.47□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.47□□□□□ -1.05
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USP11-201ENST00000218348 LTC4SQ16873 150 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 TP53RKQ96S44 253 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 LRBAP50851 2863 aa8.46□□□□□ -1.05
USP11-201ENST00000218348 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.46□□□□□ -1.05
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