RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637243.1

CHRNA4-218, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, human

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 85 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHRNA4-218	ENST00000637243	PRKX	P51817	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	CLDN17	P56750	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243		A0A0A6YYD4	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243		H3BSH0	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243		K7EIL1	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	TAAR5	O14804	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	RER1	O15258	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	FOXH1	O75593	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	SIX6	O95475	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	SFT2D2	O95562	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OPN1MW	P04001	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	HCK	P08631	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	CST2	P09228	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	GNB3	P16520	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PRKACB	P22694	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	DTYMK	P23919	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PSMB6	P28072	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	COL10A1	Q03692	680 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	KISS1	Q15726	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	MICB	Q29980	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OTP	Q5XKR4	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243		Q6YL49	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243		Q6ZSV7	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	AQP10	Q96PS8	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	RYR1	P21817	5038 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243		M0R135	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	FGF16	O43320	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	GPR137B	O60478	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	MPIG6B	O95866	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	RLN2	P04090	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHRNA4-218	ENST00000637243	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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