RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 CST7O76096 145 aa8.67□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM53BQ14153 422 aa8.67□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 PMCHL1Q16048 86 aa8.67□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ANKRD37Q7Z713 158 aa8.67□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.67□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 C4orf45Q96LM5 186 aa8.67□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR2D2Q9H210 308 aa8.67□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.67□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 UCNP55089 124 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 PSME4Q14997 1843 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 H3BP45 60 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 M0R2Z0 102 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FHITP49789 147 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TNFSF10P50591 281 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 RFESDQ8TAC1 157 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CDC42EP2O14613 210 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 GABRG2P18507 467 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 EFNB2P52799 333 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 GGTLC2Q14390 218 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 PDCD1Q15116 288 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF774Q6NX45 483 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OTOSQ8NHW6 89 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC25A28Q96A46 364 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 GPA33Q99795 319 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HELTA6NFD8 242 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 C1QCP02747 245 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CD5P06127 495 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SOD3P08294 240 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 BCL2P10415 239 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HOXA6P31267 233 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC35B1P78383 322 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FBLN7Q53RD9 439 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ASB5Q8WWX0 329 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 P2RX4Q99571 388 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 VDAC1P21796 283 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HYAL1Q12794 435 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR8G5Q8NG78 346 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR1L3Q8NH93 324 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 IGHV3-13P01766 116 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 IGHV3-7P01780 117 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 NIT1Q86X76 327 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 LHX9Q9NQ69 397 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A0G2JK05 382 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 A8MWP6 167 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 H3BMH7 237 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SPINK4O60575 86 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CCL2P13500 99 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 KIR3DL2P43630 455 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC37A1P57057 533 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 LOXL3P58215 753 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 PAPPAQ13219 1627 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 RHBDL1O75783 438 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ADRA2AP08913 450 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 COL10A1Q03692 680 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 FUT7Q11130 342 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 HOGA1Q86XE5 327 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR10D3Q8NH80 312 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 NT5CQ8TCD5 201 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 GNRHR2Q96P88 292 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 GLRX2Q9NS18 164 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.65□□□□□ -1.02
SPTAN1-228ENST00000635853 ITGB1BP1O14713 200 aa8.65□□□□□ -1.03
SPTAN1-228ENST00000635853 HAND1O96004 215 aa8.65□□□□□ -1.03
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM87AP0C7U9 286 aa8.65□□□□□ -1.03
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