RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-208ENST00000620466 CCL4P13236 92 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 ORM2P19652 201 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 FDX2Q6P4F2 183 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 LYPD3O95274 346 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 LY86O95711 162 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 SULT1A2P50226 295 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 PAX5Q02548 391 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 TSC2P49815 1807 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 SEC11BP0C7V7 166 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 AREGP15514 252 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 ACP1P24666 158 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 ABHD3Q8WU67 409 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR10C1Q96KK4 312 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OOEPA6NGQ2 149 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 PITX3O75364 302 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 CELA2AP08217 269 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 ERVS71-1P61550 626 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 NHLH2Q02577 135 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 COL19A1Q14993 1142 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR1L1Q8NH94 360 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 A0A0U1RQV5 110 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 EFEMP2O95967 443 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 IL36GQ9NZH8 169 aa7.27□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 H3BQ15 152 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 NEURL1O76050 574 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 HAND1O96004 215 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 HTN1P15515 57 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 NPY1RP25929 384 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 P2RY4P51582 365 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 FOXO1Q12778 655 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 RFESDQ8TAC1 157 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 PRO1933Q9H354 126 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR5B21A6NL26 309 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 C9orf172C9J069 976 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 SPINK4O60575 86 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR3A1P47881 315 aa7.26□□□□□ -1.25
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ALMS1-208ENST00000620466 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 SYNGR2O43760 224 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 PMELP40967 661 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 EFNB1P98172 346 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 MPV17LQ2QL34 196 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 THYN1Q9P016 225 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 NAT8Q9UHE5 227 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 TCFL5Q9UL49 500 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 PSG2P11465 335 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 MGPP08493 103 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 RNF224P0DH78 156 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.26□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.25□□□□□ -1.25
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ALMS1-208ENST00000620466 CD82P27701 267 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 BRS3P32247 399 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 GAMTQ14353 236 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 RNF2Q99496 336 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 ORM1P02763 201 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 SMIM6P0DI80 62 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 ATP6V0CP27449 155 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 WDR54Q9H977 334 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 A0A1B0GTQ1 180 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 COX6B1P14854 86 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 NHLH1Q02575 133 aa7.25□□□□□ -1.25
ALMS1-208ENST00000620466 VAMP3Q15836 100 aa7.25□□□□□ -1.25
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