RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618318.1

RPRD1B-208, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-208ENST00000618318 OR2A4O95047 310 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 FSTL3O95633 263 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 IFNA2P01563 188 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 EGR1P18146 543 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 AADACP22760 399 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 OR3A1P47881 315 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 UQCRFS1P47985 274 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 PIGPP57054 158 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 RND3P61587 244 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 AESQ08117 197 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 PPP1R1AQ13522 171 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 HMGN3Q15651 99 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 MST1LQ2TV78 715 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 IGSF11Q5DX21 431 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 KCTD9Q7L273 389 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 CCL17Q92583 94 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 OR2A7Q96R45 310 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 RAB18Q9NP72 206 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 KIF25Q9UIL4 384 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 FBN2P35556 2912 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 hADV38S2A0JD32 116 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 ODAMA1E959 279 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 C5orf51A6NDU8 294 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 RNF212BA8MTL3 300 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 SIGLEC5O15389 551 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 NDUFB3O43676 98 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF737O75373 536 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 PLAUP00749 431 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 AVPP01185 164 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 HEXAP06865 529 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 DNASE1P24855 282 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 CD80P33681 288 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 CEACAM6P40199 344 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 GZMKP49863 264 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 P2RX3P56373 397 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 EDDM3BP56851 147 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 HTD2P86397 168 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 EDDM3AQ14507 147 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 CDSNQ15517 529 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 MSMO1Q15800 293 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 CR1LQ2VPA4 569 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 STUMQ69YW2 141 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.59□□□□□ -1.35
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RPRD1B-208ENST00000618318 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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RPRD1B-208ENST00000618318 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.59□□□□□ -1.35
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RPRD1B-208ENST00000618318 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 NEUROG1Q92886 237 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 ARL11Q969Q4 196 aa6.59□□□□□ -1.35
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RPRD1B-208ENST00000618318 GALNT14Q96FL9 552 aa6.59□□□□□ -1.35
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RPRD1B-208ENST00000618318 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 NAA60Q9H7X0 242 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 ZFP57Q9NU63 452 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 ESPL1Q14674 2120 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 CENPEQ02224 2701 aa6.59□□□□□ -1.35
RPRD1B-208ENST00000618318 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RPRD1B-208ENST00000618318 GPR37O15354 613 aa6.58□□□□□ -1.36
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