RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF404Q494X3 552 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 KLHL22Q53GT1 634 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 LIPNQ5VXI9 398 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 NANPQ8TBE9 248 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 TBX5Q99593 518 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR84Q9NQS5 396 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 C8orf4Q9NR00 106 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GTI1 187 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 CDIPTO14735 213 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV3-1P01715 115 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 GNB2P62879 340 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF85Q03923 595 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 PAX8Q06710 450 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 LPCAT4Q643R3 524 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZSR3 168 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 COMMD1Q8N668 190 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 RDH12Q96NR8 316 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 UHRF2Q96PU4 802 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 OR8B2Q96RD0 313 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 MBOAT4Q96T53 435 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 MMP26Q9NRE1 261 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 AUP1Q9Y679 476 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GVI7 797 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 A8MXK9 166 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 J3QRE1 110 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 P2RY10O00398 339 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 DLGAP1O14490 977 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 DHRS3O75911 302 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 CDK2AP2O75956 126 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 NRASP01111 189 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF12P17014 697 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 CD80P33681 288 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 GNG3P63215 75 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ACTC1P68032 377 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ACTA1P68133 377 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF154Q13106 437 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSCAN26Q16670 478 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 MICBQ29980 383 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 DDI2Q5TDH0 399 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR82Q6UXN9 313 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 SSX6Q7RTT6 188 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-216ENST00000590105 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 484.4 ms