RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586282.1

TNNT1-205, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, human

TSL 5

Gene TNNT1, Length 327 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT1-205	ENST00000586282	CYB5A	P00167	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	HLA-H	P01893	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	CELA2A	P08217	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	TACSTD2	P09758	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	PGC	P20142	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	PMCH	P20382	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	AOAH	P28039	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	TNFSF9	P41273	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	XCR1	P46094	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	ROM1	Q03395	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	KLRD1	Q13241	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	OR7A5	Q15622	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282		Q6ZVH6	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	DOK3	Q7L591	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	AQP3	Q92482	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	FGF14	Q92915	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	PECR	Q9BY49	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282		H3BRM9	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	GDF9	O60383	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	OR1I1	O60431	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	SOX14	O95416	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	RHOC	P08134	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	NGFR	P08138	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	LINC00869	P0C866	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	ZNF17	P17021	662 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	NBL1	P41271	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	GFRA1	P56159	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	DLX6	P56179	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	TCF15	Q12870	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282		Q6ZSR9	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282		Q8N976	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	SDF2	Q99470	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNNT1-205	ENST00000586282	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms