RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAA60Q9H7X0 242 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GW55 424 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 OOEPA6NGQ2 149 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 C12orf77C9JDV5 145 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSD17B6O14756 317 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 GYPAP02724 150 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SELLP14151 372 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PAX5Q02548 391 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SP6Q3SY56 376 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUX4Q9UBX2 424 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSPB11Q9Y547 144 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A0B4J2A0 478 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 C5orf51A6NDU8 294 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAP1O75689 374 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 HLA-GP17693 338 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPOXP50336 477 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 STUMQ69YW2 141 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCL13Q99616 98 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 K7N7A8 449 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 MGST3O14880 152 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 HBZP02008 142 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCL17Q92583 94 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPHA2Q96T91 129 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR31O00270 319 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXB5P09067 269 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR5AC1P0C628 307 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL2RGP31785 369 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEACAM6P40199 344 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 EDDM3BP56851 147 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFITM2Q01629 132 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 C6orf183Q5T699 404 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 GALMQ96C23 342 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SDSLQ96GA7 329 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 GAFA1Q96PS6 74 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 RDH8Q9NYR8 311 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCA4P78363 2273 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ODAMA1E959 279 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM178BH3BS89 294 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPPED1O15442 326 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 HEXAP06865 529 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SSTR5P35346 364 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM187Q14656 261 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF561Q8N587 486 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 RFESDQ8TAC1 157 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASB13Q8WXK3 278 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARL11Q969Q4 196 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB18Q9NP72 206 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPTX1A8MV57 137 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGS11O94810 467 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 LURAP1Q96LR2 239 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PPR1 153 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 LGALS8O00214 317 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms