RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559771.5

USP3-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, human

TSL 4

Gene USP3, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP3-215	ENST00000559771	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	HHLA2	Q9UM44	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771		A0A1W2PPE2	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771		A0A1W2PR64	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771		A0A1W2PRV1	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	F2RL2	O00254	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	PDCD5	O14737	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SNAPC5	O75971	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	HAND1	O96004	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	KRT8	P05787	483 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	BCL3	P20749	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	DUSP1	P28562	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	KIR3DL2	P43630	455 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	OR3A1	P47881	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SCAND1	P57086	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	RAB25	P57735	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	PITPNA	Q00169	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	CBX3	Q13185	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	ZNF146	Q15072	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	ZNF79	Q15937	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	SNX22	Q96L94	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP3-215	ENST00000559771	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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