RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 ARL11Q969Q4 196 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 RCN3Q96D15 328 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 PYURFQ96I23 114 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 RDH12Q96NR8 316 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.24□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 Q6P435 159 aa7.24□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 STPG3Q8N7X2 389 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 LFNGQ8NES3 379 aa7.24□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 C10orf35Q96D05 121 aa7.24□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 GNG12Q9UBI6 72 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 H3BUA1 57 aa7.23□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 LANCL1O43813 399 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF20P17024 532 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 CCL1P22362 96 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF137PP52743 207 aa7.23□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 POC5Q8NA72 575 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 THRSPQ92748 146 aa7.23□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 OPALINQ96PE5 141 aa7.23□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.22□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 CPOQ8IVL8 374 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 BVESQ8NE79 360 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 NPBQ8NG41 125 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 UBALD1Q8TB05 177 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 SPSB1Q96BD6 273 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 CLCC1Q96S66 551 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 APOL4Q9BPW4 351 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 TEX12Q9BXU0 123 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-211ENST00000559460 FBXL15Q9H469 300 aa7.22□□□□□ -1.25
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SMAD3-211ENST00000559460 C11orf94C9JXX5 98 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 RRHO14718 337 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 SLC31A2O15432 143 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 SPINT2O43291 252 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV1D-12P01611 117 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM225BP0DP42 221 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 ATF1P18846 271 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 MAGEA2P43356 314 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 KIR2DS2P43631 304 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 MAP2K4P45985 399 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 ALDH3A2P51648 485 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 CXCR4P61073 352 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 MED22Q15528 200 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-211ENST00000559460 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.21□□□□□ -1.26
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