RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	C14orf79	Q96F83	325 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	SPACA5	Q96QH8	159 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	GINS3	Q9BRX5	216 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	LEUTX	A8MZ59	168 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	S100A7	P31151	101 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	CD300C	Q08708	224 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	KCNK15	Q9H427	330 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	TECTA	O75443	2155 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	YPEL1	O60688	119 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	OR52E5	Q8NH55	327 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	OR4A5	Q8NH83	315 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	TNFRSF14	Q92956	283 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	YPEL2	Q96QA6	119 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	ARV1	Q9H2C2	271 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	hADV38S2	A0JD32	116 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	FNDC10	F2Z333	226 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	MPDU1	O75352	247 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	OR2H2	O95918	312 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	PIGY	Q3MUY2	71 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	S100PBP	Q96BU1	408 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	ACACA	Q13085	2346 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	CACNA1H	O95180	2353 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667		I3L521	148 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV1D-12	P01611	117 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	SERF2	P84101	59 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	HGFAC	Q04756	655 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	S100A7A	Q86SG5	101 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	RNF24	Q9Y225	148 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	CENPF	P49454	3210 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	SDK2	Q58EX2	2172 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	SRRM5	B3KS81	715 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	TOX	O94900	526 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	CECR9	P0C854	216 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	FXYD4	P59646	89 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	FAM222B	Q8WU58	562 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	CXorf58	Q96LI9	332 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	TNFSF13	O75888	250 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	OR5AC1	P0C628	307 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	PTHLH	P12272	177 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	WIPF3	A6NGB9	483 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	RBP4	P02753	201 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	HOXB5	P09067	269 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	PMS2P11	Q13670	270 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	ENY2	Q9NPA8	101 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667		A8MXK9	166 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	CLDN14	O95500	239 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	HPRT1	P00492	218 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV3-9	P01782	118 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	DAO	P14920	347 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	NTF4	P34130	210 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	RAB11A	P62491	216 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	RAB31	Q13636	194 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	SSX9	Q7RTT3	188 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667	SDSL	Q96GA7	329 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-233	ENST00000557667		A0A087WV48	116 aa		7.2	□□□□□ -1.26

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