RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555503.1

GPHN-208, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 3

Gene GPHN, Length 655 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-208ENST00000555503 ZNF649Q9BS31 505 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 TMEM133Q9H2Q1 129 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 MED4Q9NPJ6 270 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 NDE1Q9NXR1 346 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 V9GYS6 101 aa5.51□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 A0A1B0GTI1 187 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 A0A1W2PPK0 400 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ACOD1A6NK06 481 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 SIRPB1O00241 398 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 DLGAP1O14490 977 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 PRKYO43930 277 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 HAND1O96004 215 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 HMGN1P05114 100 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 HTR1DP28221 377 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ERVK11-1P61568 191 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 IL24Q13007 206 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 PLA2G7Q13093 441 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 GRK1Q15835 563 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 SPATS1Q496A3 300 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 TMEM42Q69YG0 159 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 SSX6Q7RTT6 188 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 AQP12AQ8IXF9 295 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ELMOD2Q8IZ81 293 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 DUX3Q96PT4 197 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 CHID1Q9BWS9 393 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 R4GMQ9 66 aa5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 hADV38S2A0JD32 116 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ARRDC5A6NEK1 342 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 PRAF2O60831 178 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ZNF254O75437 659 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 DCTN3O75935 186 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 CLIC3O95833 236 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 IGHV3-7P01780 117 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 RBP4P02753 201 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ARSBP15848 533 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 PRKACAP17612 351 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 BCL3P20749 454 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 NPBWR2P48146 333 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 POU3F4P49335 361 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 DYNLT3P51808 116 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 RAB25P57735 213 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 GNGT1P63211 74 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 UBE2V2Q15819 145 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 UTF1Q5T230 341 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ZNF329Q86UD4 541 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 OR5M8Q8NGP6 311 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 CANT1Q8WVQ1 401 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ASB17Q8WXJ9 295 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 STMN2Q93045 179 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 RFT1Q96AA3 541 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ATG101Q9BSB4 218 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 PKIBQ9C010 78 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 MOB1AQ9H8S9 216 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 ADGRL4Q9HBW9 690 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 SLC7A11Q9UPY5 501 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.49□□□□□ -1.53
GPHN-208ENST00000555503 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.49□□□□□ -1.53
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