RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	PI3	P19957	117 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	IGHV1-2	P23083	117 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	GNRHR	P30968	328 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	F2RL1	P55085	397 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	S100A10	P60903	97 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HLA-DRB3	P79483	266 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	TESK1	Q15569	626 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	SVBP	Q8N300	66 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR8G5	Q8NG78	346 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	BTBD17	A6NE02	478 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MPTX1	A8MV57	137 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	GCH1	P30793	250 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	TIMP3	P35625	211 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	CFHR2	P36980	270 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGDIB	P52566	201 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM219A	Q8IW50	185 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	LFNG	Q8NES3	379 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIB1	Q96RU8	372 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PROCR	Q9UNN8	238 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF250	P15622	560 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	CA6	P23280	308 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	F2R	P25116	425 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM33	P57088	247 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	TAS2R30	P59541	319 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	FXYD4	P59646	89 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	ID3	Q02535	119 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2T2	Q6IF00	324 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442		Q6P435	159 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB40C	Q96S21	281 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	GINS3	Q9BRX5	216 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	SEC11C	Q9BY50	192 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	LIME1	Q9H400	295 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	COA4	Q9NYJ1	87 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	TACC2	O95359	2948 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM218	A2RU14	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	OR5H1	A6NKK0	313 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	SYNGR1	O43759	233 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	ZG16	O60844	167 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	DFFB	O76075	338 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	NXPH2	O95156	264 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINE2	P07093	398 aa		10.01	□□□□□ -0.81

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