RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 MIOXQ9UGB7 285 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 RAB27BO00194 218 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 RGS11O94810 467 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 IGHMP01871 453 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 S100A11P31949 105 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 LINC00205P59089 165 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 IL13RA1P78552 427 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 DEFA5Q01523 94 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ALG8Q9BVK2 526 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 UBE2QL1A1L167 161 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 HMSDA8MTL9 139 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SULT1C2O00338 296 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TXNDC12O95881 172 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 RAB3BP20337 219 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 GNG3P63215 75 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ELP2Q6IA86 826 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 OR8B4Q96RC9 309 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 BTBD17A6NE02 478 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 XRCC2O43543 280 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SC5DO75845 299 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 KDM4BO94953 1096 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ZFPL1O95159 310 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 FBLN7Q53RD9 439 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TMEM106AQ96A25 262 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 RNF114Q9Y508 228 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 GABRPO00591 440 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 CFHR2P36980 270 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 MTNR1BP49286 362 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 VEGFCP49767 419 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ACTA2P62736 377 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ACTG2P63267 376 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ACTC1P68032 377 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ACTA1P68133 377 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 DYRK1AQ13627 763 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TMUB2Q71RG4 321 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 FAM206AQ9NX38 181 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 POM121CA8CG34 1229 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SSTR5P35346 364 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 KIR3DL2P43630 455 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ZNF85Q03923 595 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ACSM1Q08AH1 577 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 UQCC3Q6UW78 93 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 PXT1Q8NFP0 134 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 CLCC1Q96S66 551 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 S100A13Q99584 98 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 RNF150Q9ULK6 438 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ZNF879B4DU55 563 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 GPR137BO60478 399 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 OR2A4O95047 310 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 CD3GP09693 182 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 HILS1P60008 231 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 RAB40BQ12829 278 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms