RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 CST9LP1Q5W188 147 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 FBXL14Q8N1E6 418 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 ACY3Q96HD9 319 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 PPP5D1E7EU14 171 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV3-11P04433 115 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 H2BFMP0C1H6 154 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 MS4A10Q96PG2 267 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 BPNT1O95861 308 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN17P56750 224 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 CARD18P57730 90 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 SULF2Q8IWU5 870 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 TRDCB7Z8K6 153 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 CT45A9P0DMV2 189 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 OR3A4PP47883 348 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 FOXK1P85037 733 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 ROM1Q03395 351 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 MGAT2Q10469 447 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 SVIPQ8NHG7 77 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 IGSF23A1L1A6 192 aa8.69□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.69□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 WISP1O95388 367 aa8.69□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 CDKN1AP38936 164 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 HSPB2Q16082 182 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.69□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 TNFSF13O75888 250 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 CST7O76096 145 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 IFI6P09912 130 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 CSNK1A1P48729 337 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 TOMM40LQ969M1 308 aa8.68□□□□□ -1.02
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TRPS1-211ENST00000520276 GLRX2Q9NS18 164 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 R4GMQ9 66 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 PIGPP57054 158 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 K7EP13 123 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 YPEL1O60688 119 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 HSD11B1P28845 292 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 GALR1P47211 349 aa8.68□□□□□ -1.02
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