RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 MANBALQ9NQG1 85 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 NAT8Q9UHE5 227 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 GAGE12BA1L429 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 G3V4G9 280 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 H7BYZ3 331 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 K7ESF4 209 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SCGB1D2O95969 90 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 BCL2P10415 239 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 UNC119Q13432 240 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 FAM46BQ96A09 425 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 WDR76Q9H967 626 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 EHFQ9NZC4 300 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 FREM3P0C091 2139 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 MEGF11A6BM72 1044 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 CDIPTO14735 213 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 RAMP3O60896 148 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 QRFPP83859 136 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR4A47Q6IF82 309 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM123Q8N131 208 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PNKDQ8N490 385 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 CHST4Q8NCG5 386 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 NKD1Q969G9 470 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 C2orf72A6NCS6 295 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 FAM166BA8MTA8 275 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 DBHP09172 617 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 GP1BBP13224 206 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PGCP20142 388 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ALOX5APP20292 161 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PAX2Q02962 417 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SLC17A1Q14916 467 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 COX15Q7KZN9 410 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM186Q96B77 213 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PRSS50Q9UI38 385 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PQD3 144 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 XRCC2O43543 280 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SAP30O75446 220 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 RENP00797 406 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 BGLAPP02818 100 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ADIRFQ15847 76 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 BSXQ3C1V8 233 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 GUSBP11Q6P575 273 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR5B3Q8NH48 314 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF596Q8TC21 504 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 NICN1Q9BSH3 213 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 GNG13Q9P2W3 67 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 DHDHQ9UQ10 334 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PPIAL4DF5H284 164 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PITX3O75364 302 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 MPZL1O95297 269 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 HLA-DQA2P01906 255 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 RAC3P60763 192 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ARG2P78540 354 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 EMC4Q5J8M3 183 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 CALHM1Q8IU99 346 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 UHRF2Q96PU4 802 aa7.29□□□□□ -1.24
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