RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	HAND1	O96004	215 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	HRAS	P01112	189 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	F2R	P25116	425 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	G6PC	P35575	357 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	AES	Q08117	197 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB124	Q8NES8	71 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MARVELD3	Q96A59	401 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PMS2P11	Q13670	270 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	IGFBP7	Q16270	282 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MDP1	Q86V88	176 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	R3HDM4	Q96D70	268 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	AQP10	Q96PS8	301 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	KLK10	O43240	276 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SYNGR1	O43759	233 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	HSBP1	O75506	76 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	HIST1H3A	P68431	136 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ATRAID	Q6UW56	229 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	VWA8	A3KMH1	1905 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	SI	P14410	1827 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PAGE4	O60829	102 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CD8A	P01732	235 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PMCH	P20382	165 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	NPBWR2	P48146	333 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	HES4	Q9HCC6	221 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	VAX2	Q9UIW0	290 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	HSF4	Q9ULV5	492 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MED13L	Q71F56	2210 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GU03	582 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MPTX1	A8MV57	137 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CHEK1	O14757	476 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ATP6V1F	Q16864	119 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	PMS2CL	Q68D20	193 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	DOK5	Q9P104	306 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CLN8	Q9UBY8	286 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TTC28	Q96AY4	2481 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf94	C9JXX5	98 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193		K7EQM0	130 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MMP9	P14780	707 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF708	P17019	499 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CTRB1	P17538	263 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	KLK2	P20151	261 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CCL17	Q92583	94 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193		Q96M66	194 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MS4A10	Q96PG2	267 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	GPR87	Q9BY21	358 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	IL36G	Q9NZH8	169 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA1456	Q9P272	454 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	NAT8	Q9UHE5	227 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MGAM	O43451	1857 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	LY86	O95711	162 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CYC1	P08574	325 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CT45A10	P0DMU9	189 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TNFRSF1A	P19438	455 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	FGF12	P61328	243 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	IL22RA2	Q969J5	263 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	GFI1	Q99684	422 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193		Q9N2K0	584 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	FCN1	O00602	326 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	ST8SIA5	O15466	376 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	GDF9	O60383	454 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	BPIFB3	P59826	476 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		6.96	□□□□□ -1.29
NEK1-208	ENST00000512193	AARD	Q4LEZ3	155 aa		6.96	□□□□□ -1.29

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