RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489763.1

TRBV12-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 12-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV12-2, Length 344 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-2-201ENST00000489763 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 SMIM3Q9BZL3 60 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 SHARPINQ9H0F6 387 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 WFDC1Q9HC57 220 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 ZFP57Q9NU63 452 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 ASF1BQ9NVP2 202 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 MED9Q9NWA0 146 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 DUX4Q9UBX2 424 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 FBXL17Q9UF56 701 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 Q9UFV3 132 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 RNF150Q9ULK6 438 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 ZNF835Q9Y2P0 537 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 RAXQ9Y2V3 346 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 NSG2Q9Y328 171 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 POMT1Q9Y6A1 747 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 MED12LQ86YW9 2145 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 URB1O60287 2271 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 MYO7BQ6PIF6 2116 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 DPRXA6NFQ7 191 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 OOEPA6NGQ2 149 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 DEFB108AA8MXU0 73 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 SRRM5B3KS81 715 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 C12orf77C9JDV5 145 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 IFNL4K9M1U5 179 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 SHOXO15266 292 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 FGF16O43320 207 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 NXPH3O95157 252 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 CDS2O95674 445 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 IGHV1-46P01743 117 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 IGHV3-13P01766 116 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 HEXAP06865 529 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 SERPINE2P07093 398 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 FGF2P09038 288 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR8U9P0C7N5 309 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 TNFSF4P23510 183 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 F2RP25116 425 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 LMO1P25800 156 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 CCKARP32238 428 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 TMEM33P57088 247 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 SELENOVP59797 346 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 VAMP2P63027 116 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 RBPJQ06330 500 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 EDDM3AQ14507 147 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 GNMTQ14749 295 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 LTC4SQ16873 150 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 NMSQ5H8A3 153 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 FAM201AQ5SY85 155 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 GPR157Q5UAW9 335 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 C22orf34Q6ZV56 151 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR8U1Q8NH10 309 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 RFESDQ8TAC1 157 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 TMED6Q8WW62 240 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 RND1Q92730 232 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 IL22RA2Q969J5 263 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 ARL11Q969Q4 196 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 MARC2Q969Z3 335 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 MARVELD3Q96A59 401 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 COQ2Q96H96 371 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 SNX22Q96L94 193 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 LURAP1Q96LR2 239 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 LINC00052Q96N35 136 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR2V2Q96R30 315 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms