RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	CMTM3	Q96MX0	182 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ING3	Q9NXR8	418 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	MEIOC	A2RUB1	952 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	VGLL3	A8MV65	326 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	VENTX	O95231	258 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	MELTF	P08582	738 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	OMG	P23515	440 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	COX7A1	P24310	79 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	HTD2	P86397	168 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZS49	121 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	SPINT2	O43291	252 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	DIRAS3	O95661	229 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	HBZ	P02008	142 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	UTF1	Q5T230	341 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	NDNF	Q8TB73	568 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	MALSU1	Q96EH3	234 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	DNHD1	Q96M86	4753 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ARG1	P05089	322 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	IER3	P46695	156 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	RORC	P51449	518 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	DYNLT3	P51808	116 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	C17orf50	Q8WW18	174 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	MMP28	Q9H239	520 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290		Q9N2K0	584 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	STAB1	Q9NY15	2570 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290		J3QR06	171 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	FCGR3A	P08637	254 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	GNB3	P16520	340 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	DTYMK	P23919	212 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF137P	P52743	207 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	SPCS2	Q15005	226 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	OR1L1	Q8NH94	360 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PRD5	423 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PRF3	423 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PRM7	423 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290		H3BMQ9	156 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	HTR1D	P28221	377 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	PRRX1	P54821	245 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	LGALS4	P56470	323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	PITPNA	Q00169	270 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	BAMBI	Q13145	260 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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