RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, human

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPC1-208	ENST00000469694	GAGE1	Q13065	139 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	CALHM2	Q9HA72	323 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	IGSF23	A1L1A6	192 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	XKRY2	A2RUG3	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ZNF732	B4DXR9	585 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	CA11	O75493	328 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	VAMP5	O95183	116 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	PPA1	Q15181	289 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	DHH	O43323	396 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	HBE1	P02100	147 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	GLI4	P10075	376 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	PRSS12	P56730	875 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	RAB11A	P62491	216 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	TLE4	Q04727	773 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	TMEM54	Q969K7	222 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694		F5H5K5	113 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	NPS	P0C0P6	89 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	PDLIM4	P50479	330 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	PLGLB1	Q02325	96 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	LGI3	Q8N145	548 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	EPHA1	P21709	976 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	MSR1	P21757	451 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	FAM57B	Q71RH2	274 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694		V9GYS6	101 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	FAM221A	A4D161	298 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	TMEM210	A6NLX4	147 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	LINC00614	P0C842	121 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	B4GALT1	P15291	398 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	OMG	P23515	440 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ALDH3B1	P43353	468 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	SP1	P08047	785 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	MEOX1	P50221	254 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	LHX2	P50458	406 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	CCL11	P51671	97 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	PMP22	Q01453	160 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	KISS1	Q15726	138 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ACY3	Q96HD9	319 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	ATM	Q13315	3056 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	MSTN	O14793	375 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	P2RY6	Q15077	328 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	C10orf128	Q5T292	105 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GPC1-208	ENST00000469694	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5

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