RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-208ENST00000463533 ZANQ9Y493 2812 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0A6YYH2 397 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PPH5 198 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 A6NJ64 397 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINE3A8MV23 424 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 C17orf98A8MV24 154 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 J3QLI3 93 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 M0R1W7 72 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 SSX5O60225 188 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 CA11O75493 328 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 NAPSAO96009 420 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 CGB3P0DN86 165 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 CGB7P0DN87 165 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 MMP9P14780 707 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 OMGP23515 440 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 GATA3P23771 443 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 SSTR5P35346 364 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 TALDO1P37837 337 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 PAX5Q02548 391 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 HACD4Q5VWC8 232 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 CNIH2Q6PI25 160 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 GAPTQ8N292 157 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1L1Q8NH94 360 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL11Q969Q4 196 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 MMP27Q9H306 513 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 CALYQ9NYX4 217 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 KPTNQ9Y664 436 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 HIVEP2P31629 2446 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PRD5 423 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PRF3 423 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PRM7 423 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM172BPA6NC97 362 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 DBX1A6NMT0 343 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 C12orf77C9JDV5 145 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 C15orf65H3BRN8 121 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 HLA-DQB1P01920 261 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 FCER2P06734 321 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 FCGR3AP08637 254 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 GZMHP20718 246 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 NFYBP25208 207 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 TNFSF8P32971 234 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 MNDAP41218 407 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 GNG2P59768 71 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 KLRD1Q13241 179 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL6IP1Q15041 203 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 UTF1Q5T230 341 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 C6orf183Q5T699 404 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR18Q8N4B5 295 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 LHX4Q969G2 390 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 Q9N2K0 584 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR13Q9NZ81 148 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PPE2 198 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PR64 198 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PRV1 198 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 MEIOCA2RUB1 952 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 INAFM1C9JVW0 142 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ORC5O43913 435 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 CLPXO76031 633 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV3-7P01780 117 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 HBZP02008 142 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 MELTFP08582 738 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms