RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ZP4Q12836 540 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SYS1Q8N2H4 156 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IGSF8Q969P0 613 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IKZF5Q9H5V7 419 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 HCRTO43612 131 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 DUX3Q96PT4 197 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 DNM1P46Q6ZS02 220 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 SCN1AP35498 2009 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C21orf140B9A014 251 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CDC42EP2O14613 210 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN7O95471 211 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 FAM157BP0CG42 384 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CXCL8P10145 99 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CFHR2P36980 270 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DLX6P56179 175 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PCBD1P61457 104 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ZXDAP98168 799 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 NOXO1Q8NFA2 376 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ST8SIA1Q92185 356 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 AQP3Q92482 292 aa4.88□□□□□ -1.63
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