RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.86□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.86□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.86□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 CUBNO60494 3623 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 JMJD1CQ15652 2540 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 POM121CA8CG34 1229 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 SERPINE3A8MV23 424 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 F2RL2O00254 374 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 HBZP02008 142 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 PRRX1P54821 245 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 CDNFQ49AH0 187 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 Q6YL49 198 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 OR1L1Q8NH94 360 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 DIABLOQ9NR28 239 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.85□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 A0A0A6YYH2 397 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 A6NJ64 397 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 VENTXO95231 258 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 ARFRP1Q13795 201 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 SPCS2Q15005 226 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 OR9G1Q8NH87 305 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 AP3S1Q92572 193 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 ABCG5Q9H222 651 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.84□□□□□ -0.03
PTX4-202ENST00000440447 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 MELTFP08582 738 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 HTR1DP28221 377 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 TALDO1P37837 337 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 HMGN3Q15651 99 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 MZT2AQ6P582 158 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 C17orf50Q8WW18 174 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 LEAP2Q969E1 77 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 GALMQ96C23 342 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 ISOC1Q96CN7 298 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 MALSU1Q96EH3 234 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 Q9N2K0 584 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 ESM1Q9NQ30 184 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 GNG12Q9UBI6 72 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 PSG11Q9UQ72 335 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.83□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 CCDC160A6NGH7 325 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 TRIM77I1YAP6 450 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 J3QR06 171 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 IGLV1-47P01700 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 IGHV3-7P01780 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 SOX6P35712 828 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 GNG10P50151 68 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 LOXL3P58215 753 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 UTF1Q5T230 341 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 Q6ZPA2 131 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 AJUBAQ96IF1 538 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 DPM3Q9P2X0 92 aa14.82□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 H3BMQ9 156 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 HLA-DRB3P79483 266 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 HTD2P86397 168 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 PITPNAQ00169 270 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 Q3ZCU0 254 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 HACD4Q5VWC8 232 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 TMEM86BQ8N661 226 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 CMTM3Q96MX0 182 aa14.81□□□□□ -0.04
PTX4-202ENST00000440447 DUX5Q96PT3 197 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms