RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
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PRAME-209ENST00000439106 BEAN1Q3B7T3 259 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 CT45A1Q5HYN5 189 aa10.97□□□□□ -0.65
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PRAME-209ENST00000439106 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.97□□□□□ -0.65
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