RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 PGA4P0DJD7 388 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 PGA5P0DJD9 388 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 GZMHP20718 246 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 G6PCP35575 357 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 PSG5Q15238 335 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 BET1LQ9NYM9 111 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 PDE6DO43924 150 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 ZP1P60852 638 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 FDX2Q6P4F2 183 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 Q6ZN92 141 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 OR51M1Q9H341 326 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A0G2JK05 382 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A1W2PN81 502 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 HTR1DP28221 377 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 CT55Q8WUE5 264 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 CD74P04233 296 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 LRP11Q86VZ4 500 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MS4A18H0YCH9 400 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SP1P08047 785 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 HOXA6P31267 233 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MS4A18Q3C1V0 323 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 RNF122Q9H9V4 155 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SEMA7AO75326 666 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MMP9P14780 707 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 ORM2P19652 201 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MAGEA5P43359 124 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 NHLH1Q02575 133 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 C3AR1Q16581 482 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 CRYABP02511 175 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM157CP0CG43 387 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 OR10J1P30954 320 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MPLP40238 635 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 B2MP61769 119 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 PSG4Q00888 419 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 LINC00596Q86U02 117 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 RNF2Q99496 336 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM206AQ9NX38 181 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 PLXNB2O15031 1838 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A1B0GTQ1 180 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MPTX1A8MV57 137 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 RECKO95980 971 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 TRGC2P03986 189 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 FCARP24071 287 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF488Q96MN9 340 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 RNF24Q9Y225 148 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 LHFPL6Q9Y693 200 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 M0QZK8 103 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 ACTL6AO96019 429 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 CD8AP01732 235 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 PRF1P14222 555 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 RSG1Q9BU20 258 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 WDR54Q9H977 334 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC2A8Q9NY64 477 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 RTTNQ86VV8 2226 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 M0R2Z0 102 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 OR5AL1P0C617 328 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 HIST3H3Q16695 136 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms