RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 LFNGQ8NES3 379 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF700Q9H0M5 742 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF114Q9Y508 228 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MWP6 167 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 H0Y980 276 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFSF11O14788 317 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C1QTNF9P0C862 333 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IL2RGP31785 369 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10H5Q8NGA6 315 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR35Q9HC97 309 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MTCP1P56278 107 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ARFRP1Q13795 201 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PDCD1Q15116 288 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 UTF1Q5T230 341 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB24Q969Q5 203 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT5AP41221 380 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR146Q96CH1 333 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 HES4Q9HCC6 221 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ACACBO00763 2458 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF727A8MUV8 499 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 F5H5K5 113 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM250H0YL14 139 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NUPR1O60356 82 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TRGC2P03986 189 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TRGC1P0CF51 173 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 COX5BP10606 129 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF12P61328 243 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1L1Q8NH94 360 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNGR1O43759 233 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SCRG1O75711 98 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IGFBP7Q16270 282 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OSR2Q8N2R0 312 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF611Q8N823 705 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CYTIPO60759 359 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR13C7P0DN81 318 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL4P13236 92 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SRD5A2P31213 254 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR3A2P47893 321 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPRSS3P57727 454 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB1AP62820 205 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GNB2P62879 340 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TSC22D1Q15714 1073 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SWI5Q1ZZU3 235 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 Q8N976 141 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 EXTL1Q92935 676 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF160Q9HCG1 818 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPRSS2O15393 492 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CST7O76096 145 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 S100A10P60903 97 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSM6Q6P461 480 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DL5AQ8N109 375 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TSTD1Q8NFU3 115 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 STRADBQ9C0K7 418 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB4BP61018 213 aa3.05□□□□□ -1.92
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