RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PCOLCEQ15113 449 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RGNQ15493 299 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST3H3Q16695 136 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZSR3 168 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS45Q7RTY3 260 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 POC1AQ8NBT0 407 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A18PA6NE21 464 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A16PA6NEW6 464 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 AKAIN1P0CW23 69 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFRSF1BP20333 461 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SRP14P37108 136 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FABP6P51161 128 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 P2RX1P51575 399 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A1P53007 311 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00303Q3SY05 128 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF683Q8IZ20 524 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC3BQ96PB8 259 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 NDC1Q9BTX1 674 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SCN5AQ14524 2016 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 KLK2P20151 261 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ALOX5APP20292 161 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYBA2P53672 197 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 POU2AF1Q16633 256 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 LAS2Q8IYD9 372 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10G6Q8NH81 332 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CARD19Q96LW7 228 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMB11A5LHX3 300 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC22A20A6NK97 555 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFRSF10CO14798 259 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 GPD1P21695 349 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 INSL3P51460 131 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R50P59544 299 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS24P62847 133 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35A1P78382 337 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF345Q14585 488 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMF1Q92530 271 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 NEIL2Q969S2 332 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 HEATR5AQ86XA9 2040 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 NCKAP5O14513 1909 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 P04436 131 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 KLK1P06870 262 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CELA3BP08861 270 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CD38P28907 300 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ZXDBP98169 803 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF415Q09FC8 603 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXF1Q12946 379 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CR1LQ2VPA4 569 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 RASL11AQ6T310 242 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF44Q7L0R7 432 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP43Q8NFH3 380 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 COQ2Q96H96 371 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF670Q9BS34 389 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNJ16Q9NPI9 418 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 MT-CO3P00414 261 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SOD1P00441 154 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 P2RY1P47900 373 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CAMPP49913 170 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL2L1Q07817 233 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TUSC3Q13454 348 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 LCN15Q6UWW0 184 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CHRDL2Q6WN34 429 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TEX45Q8NA69 505 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms