RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 RNF122Q9H9V4 155 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 LY75O60449 1722 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 IDSB3KWA1 339 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 PLA2G10O15496 165 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 EFSO43281 561 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 ISG15P05161 165 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 LYZP61626 148 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 OR11H1Q8NG94 326 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 OR11H2Q8NH07 326 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 MFAP2P55001 183 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 OR2Y1Q8NGV0 311 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 ZFP64Q9NPA5 681 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 C12orf49Q9H741 205 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 ZNF124Q15973 351 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF519Q8TB69 540 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 AICDAQ9GZX7 198 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 EFNB1P98172 346 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 GAPTQ8N292 157 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 ELSPBP1Q96BH3 223 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 OR2A7Q96R45 310 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 AUP1Q9Y679 476 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 A0A1W2PQM1 296 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 RASL11AQ6T310 242 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 F11P03951 625 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 CD300CQ08708 224 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 OR10D3Q8NH80 312 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 TINAGQ9UJW2 476 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 GNG7O60262 68 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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