RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 FAM219AQ8IW50 185 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 TEX29Q8N6K0 151 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 CCL19Q99731 98 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 RP1P56715 2156 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 SFT2D2O95562 160 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 GZMHP20718 246 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 IGFBP7Q16270 282 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 OTPQ5XKR4 325 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 TMPRSS2O15393 492 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 PF4V1P10720 104 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 MMP9P14780 707 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 CALCRP30988 508 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 RABAC1Q9UI14 185 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 PPP1CBP62140 327 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 CLLU1Q5K131 121 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 OR2T2Q6IF00 324 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 BLNKQ8WV28 456 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 GPR132Q9UNW8 380 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 ARG1P05089 322 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 Q8NFD4 153 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 SLC25A4P12235 298 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 LYZP61626 148 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF90Q03938 601 aa7.11□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 NINQ8N4C6 2090 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 JTBO76095 146 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 ZBTB25P24278 435 aa7.11□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 THYN1Q9P016 225 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.11□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 ABHD3Q8WU67 409 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 DKK4Q9UBT3 224 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 AK3Q9UIJ7 227 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.11□□□□□ -1.27
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PTPN3-201ENST00000262539 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV3-13P01766 116 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV3-7P01780 117 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 GAMTQ14353 236 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 DEPPQ9NTK1 212 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPN3-201ENST00000262539 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.1□□□□□ -1.27
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