RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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NANOG-201ENST00000229307 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.85□□□□□ -1.31
NANOG-201ENST00000229307 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.85□□□□□ -1.31
NANOG-201ENST00000229307 TMEM186Q96B77 213 aa6.85□□□□□ -1.31
NANOG-201ENST00000229307 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.85□□□□□ -1.31
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NANOG-201ENST00000229307 METRNQ9UJH8 293 aa6.85□□□□□ -1.31
NANOG-201ENST00000229307 AUP1Q9Y679 476 aa6.85□□□□□ -1.31
NANOG-201ENST00000229307 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.85□□□□□ -1.31
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NANOG-201ENST00000229307 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
NANOG-201ENST00000229307 Q9N2K0 584 aa6.84□□□□□ -1.31
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NANOG-201ENST00000229307 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.84□□□□□ -1.31
NANOG-201ENST00000229307 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.84□□□□□ -1.31
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NANOG-201ENST00000229307 HOGA1Q86XE5 327 aa6.84□□□□□ -1.31
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NANOG-201ENST00000229307 ZNHIT1O43257 154 aa6.83□□□□□ -1.32
NANOG-201ENST00000229307 SOX15O60248 233 aa6.83□□□□□ -1.32
NANOG-201ENST00000229307 CLPSP04118 112 aa6.83□□□□□ -1.32
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