RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 FZR1Q9UM11 496 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SVILO95425 2214 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 RNF212BA8MTL3 300 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 WNT2P09544 360 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SEC11BP0C7V7 166 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 MMP9P14780 707 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 AKR1C2P52895 323 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 BTN1A1Q13410 526 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 Q6ZRG5 221 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 MUCL1Q96DR8 90 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 LUZP4Q9P127 313 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.98□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM218A2RU14 115 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OOEPA6NGQ2 149 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TM4SF5O14894 197 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PITX3O75364 302 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PSG2P11465 335 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 EPHA1P21709 976 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 IL2RGP31785 369 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 LPAR6P43657 344 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 GABRA2P47869 451 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 RAB5CP51148 216 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 BAXQ07812 192 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TESK1Q15569 626 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 WDR82Q6UXN9 313 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SVBPQ8N300 66 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 GALMQ96C23 342 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 GINS3Q9BRX5 216 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 MSL2Q9HCI7 577 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 GTF3C1Q12789 2109 aa6.97□□□□□ -1.29
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VAMP3-201ENST00000054666 F8W036 122 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 M0R1B8 84 aa6.97□□□□□ -1.29
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VAMP3-201ENST00000054666 WNT9BO14905 357 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ATG12O94817 140 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CRYAAP02489 173 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PRH1P02810 166 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SLC25A6P12236 298 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 LMO1P25800 156 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TIMP3P35625 211 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CEACAM6P40199 344 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CD200P41217 278 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CAMLGP49069 296 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF83P51522 516 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 NHLH2Q02577 135 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 AKR1C1Q04828 323 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 MST1LQ2TV78 715 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 UBALD1Q8TB05 177 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PRR7Q8TB68 274 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 S100PBPQ96BU1 408 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ARV1Q9H2C2 271 aa6.97□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 IFNL4K9M1U5 179 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ABCD4O14678 606 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PSPNO60542 156 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OR8U9P0C7N5 309 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OR3A1P47881 315 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF616Q08AN1 781 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CLINT1Q14677 625 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 Q6ZR03 302 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 STX12Q86Y82 276 aa6.96□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.96□□□□□ -1.29
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