RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 PARP11Q9NR21 331 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 DOCK7Q96N67 2140 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TMEM218A2RU14 115 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 AGFG2O95081 481 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 IGLV1-44P01699 117 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 GRPP07492 148 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 GCH1P30793 250 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 MPV17P39210 176 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TCF15Q12870 199 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 SWI5Q1ZZU3 235 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 SLC25A31Q9H0C2 315 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 WIPI2Q9Y4P8 454 aa15.7■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 SEC11BP0C7V7 166 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 SPINK2P20155 84 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 F2RP25116 425 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 BTN1A1Q13410 526 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ERGIC1Q969X5 290 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TAAR6Q96RI8 345 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 HES4Q9HCC6 221 aa15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TNFSF13O75888 250 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 HAND1O96004 215 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 CECR9P0C854 216 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 VAMP2P63027 116 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 DEFA5Q01523 94 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 FOXF2Q12947 444 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 MST1LQ2TV78 715 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 NMSQ5H8A3 153 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 STARD4Q96DR4 205 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 LRRC46Q96FV0 321 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 GINS3Q9BRX5 216 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TINAGQ9UJW2 476 aa15.68■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 HSPA12AO43301 675 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ADAM20O43506 726 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 WISP2O76076 250 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 CGAP01215 116 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 SERPINE2P07093 398 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 SLC25A6P12236 298 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 F2RL1P55085 397 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 HMGN3Q15651 99 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 OR2C3Q8N628 320 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TLNRD1Q9H1K6 362 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 DKK4Q9UBT3 224 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ESPL1Q14674 2120 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 OR5H1A6NKK0 313 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 FBXO24O75426 580 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 RAB5CP51148 216 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 CAV2P51636 162 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 HRH4Q9H3N8 390 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 C11orf1Q9H5F2 150 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.67■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 CACNA1GO43497 2377 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 H0YL77 283 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 MLNRO43193 412 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 CRYABP02511 175 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 LMO1P25800 156 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ZNF266Q14584 549 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 IGFBP7Q16270 282 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 Q6ZS92 163 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 SVBPQ8N300 66 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 PRSS33Q8NF86 280 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TREM1Q9NP99 234 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa15.66■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 RNF212BA8MTL3 300 aa15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 WRBO00258 174 aa15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ATG12O94817 140 aa15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 LPAR6P43657 344 aa15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms