RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 GUCA2AQ02747 115 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 P2RX4Q99571 388 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf49Q9H741 205 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GU03 582 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 IFNL4K9M1U5 179 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 DYNLT3P51808 116 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 NT5CQ8TCD5 201 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PTP4A1Q93096 173 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 RARRES2Q99969 163 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 SBF1O95248 1867 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0A6YYD5 115 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0B4J293 547 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 MASP2O00187 686 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 HLA-DRB1P01911 266 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 CACNG7P62955 275 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 METTL26Q96S19 204 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 EMC6Q9BV81 110 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WUJ7 227 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ONECUT2O95948 504 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 FAM53BQ14153 422 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 OR13H1Q8NG92 308 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 RDH5Q92781 318 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PTX4Q96A99 478 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 OR8B2Q96RD0 313 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 FAM209BQ5JX69 171 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 C16orf92Q96LL3 132 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 TOX2Q96NM4 488 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PDFQ9HBH1 243 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 LCTP09848 1927 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PRR35P0CG20 571 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 FBXL6Q8N531 539 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 RBKSQ9H477 322 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 SDK2Q58EX2 2172 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 CDC14BO60729 498 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 SLC37A1P57057 533 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS8Q16651 343 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ORAI1Q96D31 301 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 SPACA5Q96QH8 159 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 MFAP4P55083 255 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 MDP1Q86V88 176 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 OPN4Q9UHM6 478 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 FCGR3AP08637 254 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 EMDP50402 254 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 SELENOTP62341 195 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 NTHL1P78549 312 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0B4J2E0 115 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GX12 115 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PITX3O75364 302 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 NAAAQ02083 359 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRT-209ENST00000612229 NEU3Q9UQ49 428 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 KCNMB1Q16558 191 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 Q6AWC8 147 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 UPK1AO00322 258 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF688P0C7X2 276 aa6.19□□□□□ -1.42
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