RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 GPA33Q99795 319 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 ATG101Q9BSB4 218 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 CHST5Q9GZS9 411 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 ASCL3Q9NQ33 180 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 ISLRO14498 428 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 CDIPTO14735 213 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 COL8A1P27658 744 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 RPL24P83731 157 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 DHRS13Q6UX07 377 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 LHX9Q9NQ69 397 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 WNT16Q9UBV4 365 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 PTP4A3O75365 173 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 VSIG10L2P0DP72 767 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 ATP6V0CP27449 155 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 TMEM65Q6PI78 240 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 TMEM251Q8N6I4 163 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 WDR31Q8NA23 367 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 OR4X1Q8NH49 305 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 ADIPOR1Q96A54 375 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 RNF122Q9H9V4 155 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 C7orf66A4D0T2 115 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 LGALS7P47929 136 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 FOXC1Q12948 553 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 LYPD8Q6UX82 237 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 TMEM38BQ9NVV0 291 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 LY75O60449 1722 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 KCNAB3O43448 404 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 FAM209AQ5JX71 171 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 RAB1BQ9H0U4 201 aa10.47□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 TMEM210A6NLX4 147 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 J3QT63 122 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 AGFG2O95081 481 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 GZMHP20718 246 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 HOXA6P31267 233 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 KIR3DL2P43630 455 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 IFITM3Q01628 133 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 MOGAT3Q86VF5 341 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 SOX8P57073 446 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 C3AR1Q16581 482 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 OR5A2Q8NGI9 324 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 VN1R17PQ8TDU5 208 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 TREM2Q9NZC2 230 aa10.46□□□□□ -0.73
TNS1-220ENST00000611415 MPLP40238 635 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MAGEA5P43359 124 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MGAT2Q10469 447 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ZNF343Q6P1L6 599 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 TEPPQ6URK8 271 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ZPLD1Q8TCW7 415 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SHANK3Q9BYB0 1731 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 GNG7O60262 68 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 OR8B3Q8NGG8 313 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 OR8B2Q96RD0 313 aa10.46□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 CORTO00230 105 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MELTFP08582 738 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 STAG3L2P0CL84 134 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 AREGP15514 252 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 NAAAQ02083 359 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ZNF665Q9H7R5 613 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SCN1AP35498 2009 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 FAM157AC9JC47 383 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 CD99P14209 185 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SFTPA2Q8IWL1 248 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ELOVL1Q9BW60 279 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 PAM16Q9Y3D7 125 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 OR8A1Q8NGG7 326 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 RNF7Q9UBF6 113 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 DCAF12L2Q5VW00 463 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 WDFY1Q8IWB7 410 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 OR2Y1Q8NGV0 311 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms