RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 IFITM10A6NMD0 228 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 IFITM5A6NNB3 132 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 DLEU1O43261 78 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 XRCC3O43542 346 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 UPK3AO75631 287 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 OR4E1P0C645 316 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 TAS2R20P59543 309 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SKP2Q13309 424 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 INSL4Q14641 139 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 OR8G1Q15617 311 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ZNF774Q6NX45 483 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 NIPAL3Q6P499 406 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ARL9Q6T311 187 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 VRK2Q86Y07 508 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 GPR137CQ8N3F9 429 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 CCL17Q92583 94 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.64□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 A0A087WWC5 75 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 A6NLC8 198 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R2P9O14990 202 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 FMO6PO60774 539 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 FARS2O95363 451 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 RLN1P04808 185 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SULT1A2P50226 295 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ACTA2P62736 377 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ACTG2P63267 376 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 MOGAT2Q3SYC2 334 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 GPR157Q5UAW9 335 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 LYG1Q8N1E2 194 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 OR2T33Q8NG76 320 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 OR13C8Q8NGS7 320 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SMIM19Q96E16 107 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 MICU1Q9BPX6 476 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SULT4A1Q9BR01 284 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 LINC00470Q9BZP3 86 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 RGCCQ9H4X1 137 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SIRT7Q9NRC8 400 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.63□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ZNF264O43296 627 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 GLCEO94923 617 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 CD34P28906 385 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 NTSP30990 170 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 DCTDP32321 178 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 OMPP47874 163 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 CX3CR1P49238 355 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ACTBP60709 375 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ST3GAL3Q11203 375 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 GAMTQ14353 236 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 CDK5R1Q15078 307 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ZNF385BQ569K4 471 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 RNF144BQ7Z419 303 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 COX18Q8N8Q8 333 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 THRSPQ92748 146 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 TMEM19Q96HH6 336 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 OR4F4Q96R69 305 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 NMES1Q9C002 83 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 DECR2Q9NUI1 292 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 DOK5Q9P104 306 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 KLK11Q9UBX7 282 aa9.62□□□□□ -0.87
HCG18-241ENST00000602290 STARD10Q9Y365 291 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms