RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590619.1

DNMT1-222, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 1 (best)

Gene DNMT1, Length 231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-222	ENST00000590619	SELENOF	O60613	162 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF44	P15621	663 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	EDN2	P20800	178 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SSTR5	P35346	364 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	GLP1R	P43220	463 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF134	P52741	427 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TNP2	Q05952	138 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CST11	Q9H112	138 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC31A2	O15432	143 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	NBR2	O15453	112 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MAGEB3	O15480	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OR2A4	O95047	310 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CD40LG	P29965	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	NUDT2	P50583	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	APOC4	P55056	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	LINC00205	P59089	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619		A0A0G2JLM5	398 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	LGALS9	O00182	355 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	DEFB4A	O15263	64 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	NDUFA3	O95167	84 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	GADD45G	O95257	159 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	NPPA	P01160	153 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	GAST	P01350	101 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FOLR2	P14207	255 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	GZMH	P20718	246 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	IL3RA	P26951	378 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	IFNGR2	P38484	337 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF137P	P52743	207 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SMIM11A	P58511	58 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	LSAMP	Q13449	338 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	RARRES2	Q99969	163 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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