RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR31Q8NA23 367 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF383Q8NA42 475 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CLDN23Q96B33 292 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 OR6C1Q96RD1 312 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR87Q9BY21 358 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 GNG13Q9P2W3 67 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CA14Q9ULX7 337 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087X0M5 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GX30 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SHISA7A6NL88 538 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF716A6NP11 495 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 E9PLN8 166 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 H7BYZ3 331 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PDE6DO43924 150 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZIC3O60481 467 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CYTIPO60759 359 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 RAMP1O60894 148 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 MPDU1O75352 247 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 YIF1AO95070 293 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 HRASP01112 189 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV1D-12P01611 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 P04436 131 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TRGC1P0CF51 173 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ERVFRD-1P60508 538 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PSG4Q00888 419 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 BSXQ3C1V8 233 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PIGYQ3MUY2 71 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 COX19Q49B96 90 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP350Q5VT06 3117 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF774Q6NX45 483 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 GAPTQ8N292 157 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 LILRB2Q8N423 598 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMF1Q92530 271 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PIGCQ92535 297 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 RARRES2Q99969 163 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CRLF2Q9HC73 371 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR35Q9HC97 309 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 GLRX2Q9NS18 164 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 F6UZH7 168 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ST8SIA5O15466 376 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SYNGR4O95473 234 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TRGC2P03986 189 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CXCL1P09341 107 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 COX5AP20674 150 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 MLF1P58340 268 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SPCS3P61009 180 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 RANP62826 216 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 GNG3P63215 75 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PLP2Q04941 152 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CATR1Q13166 79 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
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