RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DQB1P01920 261 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 MAS1P04201 325 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PFN1P07737 140 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GKN3PP0CG01 181 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 FAM106CPP0CH98 169 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 AKAIN1P0CW23 69 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CT45A10P0DMU9 189 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR12D1P0DN82 309 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GZMBP10144 247 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 RPL7P18124 248 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PPIFP30405 207 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SRIP30626 198 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 G6PCP35575 357 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TGFBR1P36897 503 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OPRD1P41143 372 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ELK3P41970 407 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GLIPR1P48060 266 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 REG1BP48304 166 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 EMDP50402 254 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 LHX2P50458 406 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PGGT1BP53609 377 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 DLX1P56177 255 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFA6P56556 154 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PFN3P60673 137 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 RPS14P62263 151 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OPCMLQ14982 345 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 BATFQ16520 125 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 FAM106AQ4KMX7 169 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SYT14P1Q58G82 188 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 AWAT1Q58HT5 328 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF542PQ5EBM4 170 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ALG10BQ5I7T1 473 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GGNBP1Q5YKI7 109 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL22Q6P050 247 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SHC4Q6S5L8 630 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZSR6 202 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SERPINA11Q86U17 422 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GKN2Q86XP6 184 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CDC20BQ86Y33 519 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CBLN2Q8IUK8 224 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 TMEM99Q8N816 258 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 THAP8Q8NA92 274 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 OR4K1Q8NGD4 311 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR10G7Q8NGN6 311 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR1S1Q8NH92 325 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF519Q8TB69 540 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CNIH3Q8TBE1 160 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 THEM6Q8WUY1 208 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PP6455Q8WZ26 134 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 RND1Q92730 232 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PPCDCQ96CD2 204 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 KAZALD1Q96I82 304 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM101Q96IK0 257 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00477Q96M19 166 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 TSPAN32Q96QS1 320 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 NRTNQ99748 197 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 DERL1Q9BUN8 251 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 HES7Q9BYE0 225 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SAMD10Q9BYL1 202 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 MED28Q9H204 178 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR52D1Q9H346 318 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 C5orf66Q9H5L9 145 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 AAMDCQ9H7C9 122 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 VSIRQ9H7M9 311 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 MOB1AQ9H8S9 216 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 Q9H8V8 135 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SAP30LQ9HAJ7 183 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ACER3Q9NUN7 267 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 DLL3Q9NYJ7 618 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 BET1LQ9NYM9 111 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 COMMD9Q9P000 198 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 CYSLTR1Q9Y271 337 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 NTNG1Q9Y2I2 539 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR1A2Q9Y585 309 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 BCL9LQ86UU0 1499 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 NFAT5O94916 1531 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 UNC13BO14795 1591 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 HECW1Q76N89 1606 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 MROH1Q8NDA8 1641 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GCC2Q8IWJ2 1684 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa2.56□□□□□ -2
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