RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870		M0R1W7	72 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	NAPSA	O96009	420 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	PTHLH	P12272	177 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	OMG	P23515	440 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	S100A5	P33763	92 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	SSTR5	P35346	364 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	DLX1	P56177	255 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	LTC4S	Q16873	150 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	CNIH2	Q6PI25	160 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	GAPT	Q8N292	157 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	RFESD	Q8TAC1	157 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	SIRPD	Q9H106	197 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	F8	P00451	2351 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	CLPX	O76031	633 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	GZMH	P20718	246 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	DLX6	P56179	175 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	PITPNA	Q00169	270 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870		Q8N7P7	452 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	TBX15	Q96SF7	602 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	SPINT2	O43291	252 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	ORC5	O43913	435 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	MMP23A	O75900	390 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	AVP	P01185	164 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	FCGR3A	P08637	254 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	MMP9	P14780	707 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	NFYB	P25208	207 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870		Q6ZPA2	131 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	LHX4	Q969G2	390 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870		Q9N2K0	584 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	OPN4	Q9UHM6	478 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TCF25-223	ENST00000568870	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		11.4	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	SSX5	O60225	188 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	HBZ	P02008	142 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	RBP4	P02753	201 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	CGB3	P0DN86	165 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	CGB7	P0DN87	165 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	HNF1A	P20823	631 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	DTYMK	P23919	212 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	PRTN3	P24158	256 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	COX7A1	P24310	79 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	TNFSF8	P32971	234 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	PRSS3	P35030	304 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	GDNF	P39905	211 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	KLRD1	Q13241	179 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	IL18	Q14116	193 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	UPRT	Q96BW1	309 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TCF25-223	ENST00000568870	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.39	□□□□□ -0.59

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