RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568145.5

FAN1-208, Transcript of FANCD2 and FANCI associated nuclease 1, human

TSL 3

Gene FAN1, Length 851 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAN1-208	ENST00000568145	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	PARP11	Q9NR21	331 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	CLN6	Q9NWW5	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	MNAT1	P51948	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	FGGY	Q96C11	551 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	MBOAT4	Q96T53	435 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	TEX12	Q9BXU0	123 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145		B2RBV5	119 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	SOX15	O60248	233 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	KRT8	P05787	483 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	VHL	P40337	213 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	RNLS	Q5VYX0	342 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	SPSB1	Q96BD6	273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	TBX5	Q99593	518 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	NEK6	Q9HC98	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	PRKY	O43930	277 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	BRI3	O95415	125 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	IGHV3-11	P01762	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	IL3RA	P26951	378 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	GK3P	Q14409	553 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	MMD	Q15546	238 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	NDE1	Q9NXR1	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145		A0A1W2PN81	502 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	METTL15	A6NJ78	407 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	SLC31A2	O15432	143 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	CST1	P01037	141 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	HLA-DRB1	P01911	266 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	OCM2	P0CE71	109 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	T-ENOL	P0DO92	83 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	FST	P19883	344 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	PRKACG	P22612	351 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	CHRNA7	P36544	502 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	PAX5	Q02548	391 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	RITA1	Q96K30	269 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145		M0R129	80 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	APOL3	O95236	402 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	ZNF20	P17024	532 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	CALB2	P22676	271 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	SPATS1	Q496A3	300 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAN1-208	ENST00000568145		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
FAN1-208	ENST00000568145		H0Y980	276 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAN1-208	ENST00000568145	TXNL1	O43396	289 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAN1-208	ENST00000568145	RGS11	O94810	467 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAN1-208	ENST00000568145	MT-ND2	P03891	347 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAN1-208	ENST00000568145	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAN1-208	ENST00000568145	GZMH	P20718	246 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAN1-208	ENST00000568145	ZNF137P	P52743	207 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAN1-208	ENST00000568145	NDP	Q00604	133 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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