RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 FABP12A6NFH5 140 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 FCGR3AP08637 254 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF728P0DKX0 622 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRSS3P35030 304 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 IL18Q14116 193 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 C17orf58Q2M2W7 97 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 BTNL3Q6UXE8 466 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF714Q96N38 554 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 Q9N2K0 584 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 MEIS3P1A6NDR6 274 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 SSTR5P35346 364 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 PITPNAQ00169 270 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAX8Q06710 450 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM131AQ6UXB0 335 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 Q8N7P7 452 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 RFESDQ8TAC1 157 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 DMRTB1Q96MA1 342 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 CALYQ9NYX4 217 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 V9GYH0 126 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 C12orf77C9JDV5 145 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 C15orf65H3BRN8 121 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 MMP23AO75900 390 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 TPPPO94811 219 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 FCER2P06734 321 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 GZMHP20718 246 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 OMGP23515 440 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 DLX1P56177 255 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 PYHIN1Q6K0P9 492 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 GVQW1Q8N7I0 195 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARL11Q969Q4 196 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAHD2AQ96GK7 314 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1W2PPH5 198 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 C17orf98A8MV24 154 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 CD5LO43866 347 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 DTYMKP23919 212 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 GDNFP39905 211 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ETV6P41212 452 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPANXN2Q5MJ10 180 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 C6orf183Q5T699 404 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRR18Q8N4B5 295 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIR3DL3Q8N743 410 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR1L1Q8NH94 360 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPX8Q8TED1 209 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SIRPDQ9H106 197 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 KPTNQ9Y664 436 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 F8P00451 2351 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 M0R1W7 72 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ORC5O43913 435 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 MMP9P14780 707 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 FOSL1P15407 271 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 GATA3P23771 443 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 DGCR2P98153 550 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 HMGN3Q15651 99 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF79Q15937 498 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 MOB1BQ7L9L4 216 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR52I2Q8NH67 350 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCGF1Q9BSM1 259 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 C7orf69Q9H7B7 122 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 OPN4Q9UHM6 478 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 POM121CA8CG34 1229 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOX4O94842 621 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 LY6G6DO95868 133 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 AVPP01185 164 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 HBZP02008 142 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 LPLP06858 475 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCTP09683 121 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 HLA-DRB3P79483 266 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 LTC4SQ16873 150 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBX15Q96SF7 602 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 LINC00574Q9H8X3 128 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCPEP1Q9HB40 452 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SIRT7Q9NRC8 400 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 AUP1Q9Y679 476 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SVEP1Q4LDE5 3571 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRDCB7Z8K6 153 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SULT1C2O00338 296 aa15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms