RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	DDT	P30046	118 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	GALNT14	Q96FL9	552 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TM2D1	Q9BX74	207 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	APLNR	P35414	380 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRDX4	Q13162	271 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF17	P17021	662 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	GALR1	P47211	349 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PKIA	P61925	76 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SP9	P0CG40	484 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLDN15	P56746	228 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TAS2R30	P59541	319 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF488	Q96MN9	340 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	DNAJC13	O75165	2243 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H2BK	O60814	126 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	OPN1MW	P04001	364 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H2BO	P23527	126 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H2BB	P33778	126 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H2BD	P58876	126 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H2BC	P62807	126 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM18	Q96B42	140 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	MUCL1	Q96DR8	90 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705		K7N7A8	449 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CBR3	O75828	277 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PSG2	P11465	335 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	MSMO1	Q15800	293 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	BSX	Q3C1V8	233 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	RAB40C	Q96S21	281 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TGOLN2	O43493	480 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SYNGR2	O43760	224 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	GLIPR1	P48060	266 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM27B	Q5VT28	67 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC25A45	Q8N413	288 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	C10orf35	Q96D05	121 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRSS50	Q9UI38	385 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	BCL2	P10415	239 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPINK9	Q5DT21	86 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TINAG	Q9UJW2	476 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	FUT9	Q9Y231	359 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	NXPH2	O95156	264 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ANOS1	P23352	680 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PSG4	Q00888	419 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	DHRS13	Q6UX07	377 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SST	P61278	116 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	RAC1	P63000	192 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ELOB	Q15370	118 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CARF	Q8N187	725 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	GRP	P07492	148 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	C12orf49	Q9H741	205 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705		Q9N2K0	584 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CACNA1H	O95180	2353 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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