RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505399.2

FBXO38-209, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 5

Gene FBXO38, Length 843 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-209	ENST00000505399	NDUFB3	O43676	98 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	RHBDL1	O75783	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	GOSR1	O95249	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	PPY	P01298	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	HPX	P02790	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	LMO1	P25800	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	CEACAM6	P40199	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	GZMK	P49863	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	RAB7A	P51149	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	VAMP2	P63027	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	COL10A1	Q03692	680 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	RAB1C	Q92928	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	NMES1	Q9C002	83 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-209	ENST00000505399	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	LGALS8	O00214	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	HSD17B6	O14756	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	MPPED1	O15442	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	MLNR	O43193	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	RP2	O75695	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	NAPSA	O96009	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	CD55	P08174	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	HOXB5	P09067	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	NDUFB7	P17568	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	EPHA1	P21709	976 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	AADAC	P22760	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	PSMB6	P28072	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	CCL8	P80075	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	BAMBI	Q13145	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	MSMO1	Q15800	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	MUC15	Q8N387	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	CCL17	Q92583	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-209	ENST00000505399	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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