RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CEBPZOSA8MTT3 80 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 PHOX2AO14813 284 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 TRAPPC6AO75865 159 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 IGFBP4P22692 258 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF726P1Q15940 193 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF787Q6DD87 383 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ABHD3Q8WU67 409 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 RFPL3SP0C7P2 107 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 PSG2P11465 335 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 NDUFB7P17568 137 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 TAS2R30P59541 319 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 GPR146Q96CH1 333 aa16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 A0A087WWC5 75 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 VDAC1P21796 283 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 EXT1Q16394 746 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 TMEM42Q69YG0 159 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CARFQ8N187 725 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 VAMP5O95183 116 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CARD18P57730 90 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 C1orf87Q8N0U7 546 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 OPA3Q9H6K4 179 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 Q9N2K0 584 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 GAB2Q9UQC2 676 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 A0A087X0M5 115 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 A0A1B0GX30 115 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 OR6C6A6NF89 314 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ARGFXA6NJG6 315 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CABLES2Q9BTV7 478 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 PLK3Q9H4B4 646 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 RNF115Q9Y4L5 304 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 BTBD17A6NE02 478 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 IFNA5P01569 189 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ADIRFQ15847 76 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 HIST1H2BLQ99880 126 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 A0A087WZY1 265 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 IFNL4K9M1U5 179 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SYNGR1O43759 233 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CLN3Q13286 438 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 STX12Q86Y82 276 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 OR5T1Q8NG75 326 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SMDT1Q9H4I9 107 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 DDTP30046 118 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 IL2RGP31785 369 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ERVS71-1P61550 626 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SRPXP78539 464 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CADM4Q8NFZ8 388 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CACNA1EQ15878 2313 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CST2P09228 141 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 RTP5Q14D33 572 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CACNG5Q9UF02 275 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 MUC3AQ02505 3323 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SRYQ05066 204 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 POM121Q96HA1 1249 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 CLDN34H7C241 214 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SERPINE2P07093 398 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 UMODP07911 640 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 BCL2P10415 239 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 DEFA4P12838 97 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 UCP1P25874 307 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SSR4P51571 173 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 RAC1P63000 192 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 PRDX4Q13162 271 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 TESK1Q15569 626 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 PRSS8Q16651 343 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 RBKSQ9H477 322 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SIRT7Q9NRC8 400 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-207ENST00000495879 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRG-207ENST00000495879 A0A1B0GU03 582 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRG-207ENST00000495879 SMCO3A2RU48 225 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRG-207ENST00000495879 BMP5P22003 454 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 218.6 ms